Jadranska euroregija sastoji se od 6 tematskih Komisija:

1. Komisija za turizam i kulturu
2. Komisija za ribarstvo
3. Komisija za promet i infrastrukturu
4. Komisija za zaštitu okoliša
5. Komisija za proizvodne aktivnosti
6. Komisija za socijalna pitanja
   

Svaka Komisija ima predsjednika i 2 potpredsjednika, čija je uloga nadziranje rada članica pojedine Komisije i koordinacija aktivnosti. Godišnji plan rada smjernica je svim članicama u uspješnom postizanju zadanih ciljeva i realizaciji zajedničkih projekata – koji će imati integralnu vrijednost za cijelo jadransko područje.